Giới thiệu
Hầu hết các chương trình kỷ luật an toàn sinh học đã chuyển sang nền tảng phần mềm RCPAQAP mới để hợp lý hóa các chương trình khảo sát, phân tích kết quả khảo sát và đánh giá hiệu suất. Các định dạng báo cáo đang được cập nhật để tuân theo cấu trúc chuẩn được sử dụng bởi các chương trình do RCPAQAP cung cấp.
Báo cáo cuối cùng
RCPAQAP Biosecurity phát hành Báo cáo cuối cùng cho các chương trình (ví dụ: Chương trình tập luyện mô phỏng) chưa chuyển sang nền tảng phần mềm mới. Báo cáo này bao gồm kết quả của tất cả các cuộc khảo sát trong mô-đun, đánh giá kết quả và tài liệu giáo dục mở rộng.
Báo cáo khảo sát
Báo cáo này tuân theo cấu trúc chuẩn được các chương trình RCPAQAP khác áp dụng và thay thế các báo cáo sơ bộ và cuối cùng trước đây.
Cấu trúc của báo cáo khảo sát cung cấp cho từng người tham gia bản tóm tắt về hiệu suất của họ, đánh giá hiệu suất của từng cá nhân, thảo luận về kết quả khảo sát với bình luận cho tất cả các mẫu và hiệu suất tích lũy. Tất cả các báo cáo về An toàn sinh học thường sẽ tuân theo cùng một cấu trúc:
1. Tóm tắt hiệu suất – Tóm tắt hiệu suất cung cấp cái nhìn tổng quan về sự tham gia và đánh giá trong chương trình.
- Tóm tắt hiệu suất cho các chương trình mẫu – Bao gồm các chương trình Mẫu Vi khuẩn, Môi trường và Vi-rút. Phần này hiển thị bảng đánh giá hiệu suất, bao gồm "kết quả của bạn", "kết quả mục tiêu/kỳ vọng" và "đánh giá" cho từng mẫu. Phần này cũng bao gồm hiệu suất tổng thể của kết quả người tham gia, với chỉ dẫn về các mẫu cần xem xét nếu kết quả không khớp với kết quả mục tiêu.
Một ví dụ về báo cáo được ban hành cho chương trình Mẫu virus có thể được xem bên dưới.Tóm tắt hiệu suất
Đánh giá hiệu suất
Mẫu: BS-VSM-23-04
Bài kiểm tra Kết quả của bạn Kết quả mong đợi Đánh giá Diễn giải cuối cùng về Ebolavirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về Marburgvirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về Lassavirus Tích cực Tích cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về virus sốt Rift Valley Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về virus sốt xuất huyết Congo Crimean Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Mẫu: BS-VSM-23-05
Bài kiểm tra Kết quả của bạn Kết quả mong đợi Đánh giá Diễn giải cuối cùng về Ebolavirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về Marburgvirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về Lassavirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về virus sốt Rift Valley Tích cực Tích cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về virus sốt xuất huyết Congo Crimean Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Mẫu: BS-VSM-23-06
Bài kiểm tra Kết quả của bạn Kết quả mong đợi Đánh giá Diễn giải cuối cùng về Ebolavirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về Marburgvirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về Lassavirus Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về virus sốt Rift Valley Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Diễn giải cuối cùng về virus sốt xuất huyết Congo Crimean Tiêu cực Tiêu cực Phù hợp Hiệu suất tổng thể
Tất cả kết quả trả về đều khớp với kết quả mong đợi.
- Tóm tắt hiệu suất của chương trình giải trình tự toàn bộ hệ gen và mẫu vi khuẩn lao –Ngoài những thông tin được bao gồm trong báo cáo khảo sát cho các chương trình mẫu vật (xem ở trên), báo cáo cho chương trình này còn có thêm thông tin, bao gồm tiêu chí đánh giá dữ liệu trình tự đã nộp, đánh giá chất lượng giải trình tự của từng mẫu và các lĩnh vực khác liên quan đến sinh vật được đánh giá (ví dụ: gọi biến thể). Ví dụ về điều này cho báo cáo được ban hành cho chương trình Giải trình tự toàn bộ hệ gen có thể được xem bên dưới.
Một ví dụ về báo cáo được phát hành cho chương trình Mẫu vi khuẩn Mycobacterial có thể được xem bên dưới:

c. Tóm tắt về hiệu suất của chương trình đối với các mối đe dọa sinh học mới nổi – Ngoài những nội dung có trong báo cáo khảo sát cho các chương trình mẫu (xem ở trên), báo cáo cho chương trình này có một bảng về 'hệ thống phương pháp mà người tham gia sử dụng' và 'kết quả mong đợi' cho mỗi mẫu.
Một ví dụ về điều này cho báo cáo được phát hành cho chương trình Các mối đe dọa sinh học mới nổi có thể được xem bên dưới. Một ví dụ về điều này cho các số báo cáo của Chương trình Mẫu vi khuẩn Mycobacteria có thể được xem bên dưới:
Tóm tắt hiệu suất
|
Hệ thống phương pháp được phòng thí nghiệm của bạn sử dụng |
|
| Loại | Phương pháp |
| Bộ dụng cụ chiết xuất | Khác (Bộ QIAmp 96 Virus QIAcube HT) |
| Hệ thống đo lường để trích xuất | Khác (Qiagen QIAcube HT) |
| Bộ khuếch đại và phát hiện | PCR thời gian thực tại nhà |
| Hệ thống đo lường để khuếch đại và phát hiện | Hệ thống sinh học ứng dụng ABI 7500 |
|
Kết quả mong đợi |
|
| Mẫu | Tác nhân gây bệnh mục tiêu |
| BS-EBT-23-01 | Virus đậu khỉ, Virus đậu mùa khác |
| BS-EBT-23-02 | Không phát hiện mầm bệnh |
| BS-EBT-23-03 | Màn hình HSV, HSV-1 |
| BS-EBT-23-04 | Virus đậu khỉ, Virus đậu mùa khác |
| BS-EBT-23-05 | Virus Vaccinia, Virus Orthopox khác |
| BS-EBT-23-06 | Màn hình HSV, HSV-2 |
2. Đánh giá kết quả – Phần xem xét kết quả của báo cáo hiển thị bảng phân tích kết quả trả về từ người tham gia.
- Đánh giá kết quả cho các chương trình mẫu vật và mối đe dọa sinh học mới nổi – Phần này hiển thị biểu đồ với kết quả định tính của bạn được đánh dấu bằng một chấm màu xanh. Tùy thuộc vào chương trình, biểu đồ cũng có thể so sánh kết quả định tính của bạn với tất cả những người tham gia khác (thanh màu xám) và những người sử dụng cùng phương pháp (lớp phủ màu xanh đậm). Một biểu đồ phân tán được cung cấp bên cạnh các phản hồi diễn giải, hiển thị kết quả định lượng (nếu có) của giá trị ngưỡng chu kỳ (Ct) cho các mục tiêu gen đặc hiệu của sinh vật trong một mẫu. Những kết quả này không được đánh giá nhưng có thể đưa ra chỉ báo về hiệu suất. Chương trình không sử dụng thiết kế hoặc phân tích thống kê để đánh giá kết quả. Kết quả cho mỗi mẫu được trình bày trên một trang riêng cho từng mục tiêu, tùy thuộc vào chương trình. Báo cáo chương trình Mẫu vi khuẩn và môi trường bao gồm đánh giá kết quả cho 'Mẫu trực tiếp', 'Nuôi cấy', 'Phân tử' và 'Xác định và thông báo'. Báo cáo chương trình Mẫu vi-rút và Mối đe dọa sinh học mới nổi bao gồm các phản hồi để diễn giải cuối cùng cho tất cả các mục tiêu đặc hiệu của mầm bệnh, một bảng hiển thị sự phân tích chi tiết của tất cả các xét nghiệm đang sử dụng và các kết quả đã gửi.
- Đánh giá kết quả cho chương trình giải trình tự toàn bộ bộ gen – Phần này hiển thị biểu đồ và biểu đồ phân tán của tất cả các câu trả lời được gửi cho bảng câu hỏi từ cổng thông tin myQAP, với kết quả được đánh dấu bằng một chấm xanh. Tùy thuộc vào loại thước đo, biểu đồ cũng có thể bao gồm phần đánh giá kết quả của bạn (ví dụ: phù hợp, không phù hợp, không phù hợp nhẹ, chưa được đánh giá, v.v.).
3. Bình luận – Mỗi báo cáo đều có phần bình luận, thảo luận về kết quả khảo sát của tất cả các mẫu. Báo cáo cũng đưa ra các đề xuất và khuyến nghị cho cuộc điều tra tiếp theo.
4. Đánh giá tích lũy – Tóm tắt hiệu suất tích lũy trong năm và những năm trước.
Đánh giá kết quả của người tham gia
RCPAQAP Biosecurity cung cấp một loạt các chương trình chuyên biệt với số lượng người tham gia đa dạng nhưng ít. Do đó, có thể không có đủ kết quả (điểm dữ liệu) cho bất kỳ cuộc khảo sát nào để xác thực thông tin về mặt thống kê.
Có một yếu tố nghiên cứu quan trọng trong việc phát triển các mẫu vật cho RCPAQAP Biosecurity, và quyền truy cập của người tham gia vào các thiết bị cần thiết để thử nghiệm các mẫu vật chuyên biệt này rất khác nhau. Các cuộc khảo sát RCPAQAP Biosecurity thường được sử dụng để hiểu hiệu suất của các thử nghiệm và thiết bị cụ thể và các ức chế có liên quan có khả năng gây trở ngại cho thử nghiệm.
Nhìn chung, các thuật ngữ được sử dụng để đánh giá kết quả khảo sát định tính được liệt kê dưới đây:
- Phù hợp – Phù hợp với mục tiêu hoặc kết quả mong đợi
- Không hài hòa – Không phù hợp với kết quả mục tiêu
- Minor Discordian – Một kết quả có thể có sự đồng thuận một phần với kết quả mục tiêu
- Chưa Đánh Giá – Kết quả không nằm trong khả năng phân tích hoặc nằm ngoài phạm vi chấp nhận để phân loại
- Không tham gia – Người tham gia không tham gia khảo sát.
Kết quả không đồng nhất sẽ được đánh dấu màu đỏ và kết quả không đồng nhất nhỏ sẽ được đánh dấu màu hổ phách. Kết quả được đánh dấu là không đồng nhất và không đồng nhất nhỏ sẽ được liệt kê trong phần tóm tắt "Hiệu suất Tổng thể" ở cuối trang.
Đối với chương trình Mẫu Mycobacterial, kết quả dự kiến cho tất cả các kết quả (trừ WGS) được xác định dựa trên sự đồng thuận của tất cả các kết quả. Kết quả chỉ được đánh giá khi có ≥ 80% người tham gia trả về cùng một giá trị và khi có 6 kết quả trở lên.
- Nếu một xét nghiệm đạt được sự đồng thuận/đồng thuận ≥ 80% từ 6 kết quả trở lên, thì giá trị này sẽ được liệt kê là giá trị kỳ vọng. Những người tham gia trả về giá trị kỳ vọng được đánh giá là "ĐỒNG THUỘC".“
- Nếu một bài kiểm tra đạt được sự đồng thuận ≥ 80% từ 6 kết quả trở lên, những người tham gia trong nhóm thiểu số được đánh giá là không nhất quán với sự đồng thuận và kết quả của họ được liệt kê là “KHÔNG PHÙ HỢP”
- Khi < 80% hoặc < 6 người tham gia đồng ý, mức độ không chắc chắn của kết quả sẽ tăng lên, do đó không có đánh giá nào được thực hiện và tất cả kết quả được báo cáo là “KHÔNG ĐÁNH GIÁ”.