Laporan Akhir

RCPAQAP Biosecurity mengeluarkan Laporan Akhir untuk program (cth Program Latihan Simulasi) yang masih belum beralih kepada platform perisian baharu. Ini mengandungi keputusan semua tinjauan dalam modul, penilaian keputusan dan bahan pendidikan yang luas.

Laporan Tinjauan

Laporan ini mengikuti struktur standard yang diterima pakai oleh program RCPAQAP lain dan menggantikan laporan awal dan akhir sebelumnya.

Struktur laporan tinjauan menyediakan peserta individu dengan ringkasan prestasi mereka, semakan prestasi individu, perbincangan hasil tinjauan dengan ulasan untuk semua sampel dan prestasi terkumpul. Semua laporan Biosekuriti secara amnya akan mengikut struktur yang sama:

1. Ringkasan Prestasi – Ringkasan prestasi menyediakan gambaran penyertaan dan penilaian dalam program.

1. Ringkasan Prestasi untuk program spesimen – Ini termasuk program Spesimen Bakteria, Alam Sekitar dan Viral. Bahagian ini menunjukkan jadual untuk penilaian prestasi yang termasuk 'hasil anda', 'sasaran/hasil yang dijangka' dan 'penilaian' untuk setiap sampel. Ia juga termasuk prestasi keseluruhan keputusan peserta, dengan petunjuk sampel yang memerlukan semakan jika keputusan tidak sepadan dengan hasil sasaran.
   Contoh ini untuk laporan yang dikeluarkan untuk program Spesimen Viral boleh dilihat di bawah.

   Ringkasan Prestasi

   Penilaian Prestasi
   	Contoh: BS-VSM-23-04
   Ujian	Keputusan Anda	Hasil yang Dijangka	Penilaian
   Tafsiran akhir Ebolavirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir Marburgvirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir Lassavirus	Positif	Positif	konkordan
   Tafsiran akhir virus demam Rift Valley	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir virus demam berdarah Congo Crimean	Negatif	Negatif	konkordan
   	Contoh: BS-VSM-23-05
   Ujian	Keputusan Anda	Hasil yang Dijangka	Penilaian
   Tafsiran akhir Ebolavirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir Marburgvirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir Lassavirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir virus demam Rift Valley	Positif	Positif	konkordan
   Tafsiran akhir virus demam berdarah Congo Crimean	Negatif	Negatif	konkordan
   	Contoh: BS-VSM-23-06
   Ujian	Keputusan Anda	Hasil yang Dijangka	Penilaian
   Tafsiran akhir Ebolavirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir Marburgvirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir Lassavirus	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir virus demam Rift Valley	Negatif	Negatif	konkordan
   Tafsiran akhir virus demam berdarah Congo Crimean	Negatif	Negatif	konkordan

   Prestasi Keseluruhan Semua keputusan mengembalikan keputusan yang sepadan dengan jangkaan.

2. Ringkasan Prestasi untuk Program Penjujukan Genom Keseluruhan dan Spesimen Mikobakteria –Sebagai tambahan kepada apa yang disertakan dalam laporan tinjauan untuk program spesimen (lihat di atas), laporan untuk program ini mempunyai maklumat tambahan, termasuk kriteria penilaian untuk data jujukan yang diserahkan, penilaian kualiti penjujukan setiap sampel dan kawasan lain yang berkaitan dengan organisma yang dinilai (contohnya panggilan varian). Contoh ini untuk laporan yang dikeluarkan untuk program Penjujukan Genom Seluruh boleh dilihat di bawah.Contoh ini untuk laporan yang dikeluarkan untuk program Spesimen Mycobacterial boleh dilihat di bawah:

   

c. Ringkasan Prestasi untuk program Ancaman Biologi Muncul – Sebagai tambahan kepada apa yang disertakan dalam laporan tinjauan untuk program spesimen (lihat di atas), laporan untuk program ini mempunyai jadual untuk 'sistem kaedah yang digunakan oleh peserta' dan 'hasil yang dijangkakan' untuk setiap sampel.
Contoh ini untuk laporan yang dikeluarkan untuk program Ancaman Biologi Muncul boleh dilihat di bawah. Contoh ini untuk isu laporan untuk Program Spesimen Mycobacterial boleh dilihat di bawah:

Ringkasan Prestasi

2. Semakan Keputusan – Bahagian semakan keputusan laporan memaparkan pecahan keputusan yang dikembalikan daripada peserta.

1. Semakan Keputusan untuk spesimen dan program Ancaman Biologi Muncul – Bahagian memaparkan graf dengan hasil kualitatif anda diserlahkan sebagai titik biru. Bergantung pada program, graf juga mungkin membandingkan hasil kualitatif anda dengan semua peserta lain (bar kelabu) dan mereka yang menggunakan kaedah yang sama (tindihan biru tua). Graf serakan disediakan bersebelahan dengan tindak balas tafsiran, memaparkan hasil kuantitatif (jika dibekalkan) nilai ambang kitaran (Ct) untuk sasaran gen khusus organisma dalam sampel. Keputusan ini tidak dinilai tetapi boleh memberi petunjuk prestasi. Program ini tidak menggunakan reka bentuk statistik atau analisis untuk menilai keputusan. Keputusan untuk setiap sampel dibentangkan pada halaman berasingan untuk setiap sasaran, bergantung pada program. Laporan program Spesimen Bakteria dan Alam Sekitar terdiri daripada semakan keputusan untuk 'Sampel Langsung', 'Budaya', 'Molekul' dan 'Pengenalan dan Pemberitahuan'. Laporan program Spesimen Viral dan Ancaman Biologi Muncul terdiri daripada respons untuk tafsiran akhir semua sasaran khusus patogen, jadual yang menunjukkan pecahan semua ujian yang digunakan dan keputusan diserahkan.
2. Semakan Keputusan untuk program Penjujukan Genom Seluruh – Bahagian ini memaparkan graf dan plot taburan semua jawapan yang diserahkan untuk soal selidik daripada portal myQAP, dengan keputusan anda diserlahkan sebagai titik biru. Bergantung pada jenis ukuran, graf mungkin juga menggabungkan semakan penilaian keputusan anda (cth. konkordan, sumbang, sumbang kecil, tidak dinilai dsb.)

3. Ulasan – Setiap laporan termasuk ulasan, membincangkan hasil tinjauan untuk semua sampel. Ia juga menyediakan cadangan dan cadangan untuk siasatan susulan.

4. Penilaian kumulatif – Ia meringkaskan prestasi kumulatif sepanjang tahun dan tahun-tahun sebelumnya.

Penilaian keputusan Peserta

RCPAQAP Biosecurity menawarkan rangkaian program khusus dengan asas peserta yang pelbagai tetapi kecil. Akibatnya, mungkin tidak ada hasil yang mencukupi (titik data) untuk mana-mana tinjauan untuk mengesahkan maklumat secara statistik.

Terdapat elemen penyelidikan penting dalam membangunkan spesimen untuk Biosekuriti RCPAQAP, dan akses peserta kepada peralatan yang diperlukan untuk menguji spesimen khusus ini sangat berbeza. Tinjauan Biosekuriti RCPAQAP sering digunakan untuk memahami prestasi ujian dan peralatan tertentu dan perencatan berkaitan yang berpotensi mengganggu ujian.

Secara umum, istilah yang digunakan untuk menilai keputusan kualitatif tinjauan disenaraikan di bawah:

• konkordan – Padan dengan sasaran atau hasil yang dijangkakan
• tidak serasi – Tidak sepadan dengan hasil sasaran
• Discordant Kecil – Keputusan yang mungkin mempunyai persetujuan separa dengan hasil sasaran
• Tidak Dinilai – Keputusan tidak berada dalam keupayaan ujian atau di luar skop penerimaan untuk penggredan
• Tiada Penyertaan – Peserta gagal mengambil bahagian dalam tinjauan.

Keputusan sumbang akan diserlahkan dengan warna merah dan hasil sumbang kecil akan diserlahkan dalam ambar. Hasil yang diserlahkan sebagai percanggahan dan percanggahan kecil akan disenaraikan dalam ringkasan 'Prestasi Keseluruhan' di bahagian bawah halaman.

Untuk program Spesimen Mycobacterial, hasil yang dijangkakan untuk semua keputusan (tidak termasuk WGS) ditentukan daripada konsensus semua keputusan. Keputusan hanya dinilai apabila ≥ 80% peserta mengembalikan nilai yang sama dan apabila terdapat 6 atau lebih keputusan.

• Jika ujian mencapai ≥ 80% konsensus/perjanjian daripada 6 atau lebih keputusan, ini kemudiannya disenaraikan sebagai nilai yang dijangkakan. Peserta yang memulangkan nilai yang dijangkakan dinilai sebagai "SESUAI"“
• Jika ujian mencapai konsensus ≥ 80% daripada 6 atau lebih keputusan, peserta dalam kumpulan minoriti dinilai sebagai tidak konsisten dengan konsensus dan keputusan mereka disenaraikan sebagai "DISCORDANT"“
• Apabila < 80% atau < 6 peserta bersetuju, ketidakpastian keputusan meningkat, jadi tiada penilaian dibuat dan semua keputusan dilaporkan sebagai "TIDAK DILARANG".