Critères d’analyse et d’évaluation des données
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Maladies infectieuses moléculaires

Introduction

Les maladies infectieuses moléculaires (MID) relèvent de la discipline de la microbiologie, mais sont spécifiquement destinées à la détection des maladies infectieuses à l'aide de techniques et de technologies moléculaires. Le MID a fait la transition vers la nouvelle plateforme logicielle du RCPAQAP en 2020 pour structurer les programmes d'enquête, analyser les résultats des enquêtes et évaluer les performances. Le format du rapport suit la structure standard utilisée par tous les programmes offerts par le RCPAQAP.

Les informations suivantes fournissent aux participants un guide pour comprendre le système d’analyse de données utilisé pour évaluer les performances des participants.

Évaluation et rapports d'enquête

Il existe trois types d'évaluation et de rapport utilisés pour les programmes MID : qualitatif, qualitatif et quantitatif et d'identification qui nécessitent une notation.

La structure des nouveaux rapports fournit aux participants un résumé des performances, un examen des performances individuelles, un examen détaillé de la méthode avec commentaires et les performances cumulatives.

Rapports d'enquête pour les programmes multiplex (qualitatif)

Les rapports d’enquête sont structurés de manière à fournir aux participants un résumé des performances, un examen des résultats, des commentaires et des performances cumulatives.

Résumé des performances – Le résumé des performances fournit un aperçu de la participation et de l'évaluation dans le cadre du programme. Cette section présente un tableau pour le « système de méthodes utilisé par un participant », les « résultats attendus » pour chaque échantillon et l'« évaluation des performances ». Le résumé répertorie également les résultats attendus, votre résultat, l'évaluation, le nombre total de participants effectuant le test et affiche la méthode de test utilisée par le participant.

L'évaluation des résultats est basée sur la cible (résultat attendu), en tenant compte du test utilisé pour déterminer le pathogène. Si un test utilisé n'a pas la capacité de détecter la cible attendue et que le résultat renvoyé n'est pas détecté, la note d'évaluation « Non évalué » sera attribuée.

La nomenclature suivante est actuellement utilisée pour l'évaluation

Concordant: Correspond à la cible ou au résultat attendu
Discordance mineure : Un résultat qui peut avoir une concordance partielle avec le résultat cible
Discordant: Ne correspond pas à la réponse cible
Non évalué : Le résultat n'est pas conforme aux capacités de l'analyse ou dépasse le cadre de l'acceptation pour le classement
Aucune participation : Le participant n'a pas participé à l'enquête

Résumé des performances : affichage de la catégorie de méthode fournie par le participant et du résultat attendu pour chaque échantillon d'enquête. L'évaluation des performances fournit une répartition des résultats renvoyés par le participant, mettant en évidence l'évaluation et le nombre de participants effectuant des tests pour le pathogène spécifique.

Examen des résultats – Les résultats de chaque échantillon sont présentés sur une page séparée, affichant un graphique à barres avec votre résultat qualitatif mis en évidence par un point bleu (), par rapport à tous les autres participants (barre grise) et à ceux utilisant la même méthode (superposition bleu foncé). Un graphique en nuage de points est fourni à côté des réponses interprétatives, affichant les résultats quantitatifs (si fournis) de la valeur Ct. Ces résultats ne sont pas évalués mais peuvent donner une indication des performances. Sous le graphique à barres et le nuage de points se trouve un tableau présentant une répartition de tous les tests utilisés et les résultats obtenus.

Commentaire – Fournit un aperçu des résultats de l’enquête obtenus pour chaque échantillon. Des suggestions et des recommandations sont fournies pour une enquête de suivi et peuvent également énumérer des lectures complémentaires à des fins pédagogiques.

Évaluation cumulative – ce tableau présente les performances cumulées de l’année et des années précédentes, afin de permettre l’examen des tendances au fil du temps.

Rapports d'enquête évaluant les mesures qualitatives et quantitatives

La structure du rapport d'enquête pour ces mesurandes reste la même en affichant le résumé des performances, l'examen des résultats, les commentaires et les performances cumulatives.

Résumé des performances – Le résumé des performances fournit un aperçu de la participation et de l'évaluation au programme. Cette section présente un tableau pour le « système de méthodes utilisé par le participant », les « résultats attendus » pour chaque échantillon et l'« évaluation des performances ». Le résumé répertorie également les résultats attendus, votre résultat, l'évaluation, le nombre total de participants effectuant le test et affiche la méthode de test utilisée par le participant.

L'évaluation des résultats qualitatifs est basée sur la cible (résultat attendu). L'évaluation des résultats quantitatifs est basée sur les spécifications de performance analytique (APS), un terme générique qui peut être appliqué à tout mesurande utilisant des plages. Dans ces programmes, l'attribution de la plage ou de l'APS est fixée à ±0,25 de la valeur médiane log10 UI/ml (ou copies/ml). La valeur médiane est déterminée à l'aide de tous les résultats des participants. La plage APS est appliquée à ces résultats médians à des fins de comparaison. Les résultats en dehors des plages APS seront indiqués sur le rapport.

La nomenclature actuellement utilisée pour l’évaluation de ces programmes est la suivante, mais inclut également la nomenclature qualitative telle qu’énumérée précédemment.

Au sein de l'APS : La valeur quantitative se situe dans la fourchette APS
Faible: La valeur quantitative du log10 est inférieure à la plage APS (-0,25 de la médiane)
Haut: La valeur quantitative du log10 est supérieure à la plage APS (+0,25 de la médiane)

Examen des résultats – Les résultats de l’enquête pour chaque échantillon sont présentés sur des pages distinctes. Chaque échantillon d’enquête mettra en évidence les résultats qualitatifs affichés sous forme de graphique à barres et d’un nuage de points adjacent, affichant les résultats quantitatifs (indiqués sous forme de valeurs Ct) tels que rapportés par tous les participants. Les résultats quantitatifs de cette composante de l’enquête ne sont pas évalués, mais une répartition de l’analyse statistique des méthodes est fournie pour mettre en évidence les performances des différentes méthodes.

Une page supplémentaire est prévue pour la composante quantitative des résultats, montrant un diagramme de dispersion des résultats globaux de la valeur log10 UI/mL (ou copies/mL) et un diagramme de dispersion des résultats de méthodes spécifiques pour une comparaison directe. Cette page fournit également un tableau présentant une répartition de tous les dosages utilisés et les résultats obtenus.

Commentaire – Fournit un aperçu des résultats de l’enquête obtenus pour chaque échantillon. Des suggestions et des recommandations sont fournies pour une enquête de suivi et également des lectures complémentaires à des fins pédagogiques.

Évaluation cumulative – Ce tableau présente les performances cumulées au cours de l’année et des années précédentes, afin de permettre l’examen des tendances au fil du temps.

Rapports d'enquête sur les programmes qui nécessitent une notation

Les rapports d’enquête sont structurés de manière à fournir aux participants un résumé des performances, un examen des résultats, des commentaires et des performances cumulatives.

Résumé des performances – Le résumé des performances fournit un aperçu de la participation et de l'évaluation dans le cadre du programme. Cette section présente un tableau pour le « système de méthodes utilisé par un participant », les « résultats attendus » pour chaque échantillon et l'« évaluation des performances ». Le résumé répertorie également les résultats attendus, votre résultat, l'évaluation, le nombre total de participants effectuant le test et affiche la méthode de test utilisée par le participant.

L'évaluation des résultats qualitatifs et génotypiques (identification) dans ces programmes est basée sur la cible (résultat attendu) et est classée en fonction de la capacité de votre test. Par exemple, si votre test ne peut pas détecter ou identifier les types à faible risque, le résultat « non détecté » correspond au résultat attendu pour le test.

La nomenclature suivante est actuellement utilisée pour l'évaluation

Concordant: Correspond à la cible ou au résultat attendu
Discordance mineure : Un résultat qui peut avoir une concordance partielle avec le résultat cible
Discordant: Ne correspond pas à la réponse cible
Non évalué : Le résultat n'est pas conforme aux capacités de l'analyse ou dépasse le cadre de l'acceptation pour le classement
Aucune participation : Le participant n'a pas participé à l'enquête

Examen des résultats – Les résultats de chaque échantillon sont présentés sur une page distincte, affichant un graphique à barres du résultat qualitatif renvoyé par rapport à tous les autres participants et à ceux utilisant la même méthode. Un diagramme de dispersion est également fourni pour afficher les résultats quantitatifs renvoyés, qui sont comparés à tous les autres participants rapportant une valeur Ct. Ces résultats ne sont pas évalués mais peuvent donner une indication de la performance. Un graphique à barres supplémentaire sous ces graphiques affiche les réponses pour l'interprétation finale, où les réponses cibles sont mises en évidence par des barres grises et les réponses non cibles sont mises en évidence en rouge.

Les performances de la méthode sont également fournies dans un tableau, montrant une répartition de tous les tests utilisés et les résultats obtenus.

Commentaire/Critique – Une synthèse des objectifs de l’enquête et des résultats obtenus est présentée dans la section commentaires/révisions. Des suggestions et des recommandations sont fournies pour le suivi ou l’investigation, ainsi que des lectures complémentaires à des fins pédagogiques.

Évaluation cumulative – Ce tableau présente les performances cumulées au cours de l’année et des années précédentes, afin de permettre l’examen des tendances au fil du temps.

Dernière mise à jour le 09 août 2024
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